В России разработана диагностическая панель на основе секвенирования нового поколения, позволяющая одновременно исследовать 27 вирусных мишеней — 26 респираторных вирусов и вирус кори. Разработка создана специалистами Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора.
В отличие от стандартной ПЦР, при которой заранее определяется перечень исследуемых возбудителей, новая панель позволяет одновременно анализировать широкий спектр вирусов в одном образце. При выявлении возбудителя возможно определить его генетический вариант или субтип и обнаружить значимые мутации.
Для педиатрической практики такой подход может иметь значение при тяжелом или нетипичном течении респираторной инфекции, когда клиническая картина не позволяет предположить конкретную этиологию, а стандартная диагностика остается отрицательной. Одновременный поиск нескольких возбудителей также позволяет выявлять вирусные коинфекции.
Еще одно потенциальное применение — эпидемиологические расследования. Генетическая характеристика возбудителя может помочь установить его вариант и проследить распространение инфекции при возникновении вспышки.
В настоящее время панель используется только в научных исследованиях и не применяется для постановки медицинского диагноза. Для клинического использования необходимо зарегистрировать медицинское изделие. По данным разработчиков, полный лабораторный цикл потенциально может занимать около суток, а дальнейшая задача — сделать исследование доступным по стоимости для практического применения.
Разработка основана на системе геномного эпидемиологического надзора VGARus, объединяющей около 500 тыс. геномных последовательностей возбудителей. В дальнейшем планируется создание аналогичных панелей для диагностики кишечных инфекций, инфекций центральной нервной системы и детских экзантем.
Для врача принципиальное значение будет иметь не само расширение числа выявляемых вирусов, а возможность получить этиологическую информацию в случаях, когда стандартного диагностического алгоритма недостаточно. При этом обнаружение вирусной нуклеиновой кислоты должно интерпретироваться с учетом клинической картины, сроков заболевания и вероятности носительства или остаточного выделения возбудителя.
